La Barriera Corallina Mesoamericana si estende per 1.000 chilometri da Isla Contoy all'Honduras, e Cancun si trova al suo ingresso settentrionale. Puerto Morelos, 36 chilometri a sud della zona alberghiera, è diventato Parco Marino Nazionale nel 1998, proteggendo 9.
066 ettari di formazioni coralline che ospitano 65 specie di coralli duri e più di 500 specie di pesci. Le partenze mattutine tra le 07:00 e le 11:00 coincidono con l'acqua più limpida e le condizioni di superficie più calme, quando la visibilità supera abitualmente i 30 metri.
Le escursioni di snorkeling a Cancun si dividono in tre ecosistemi: le piattaforme coralline aperte al largo di Puerto Morelos e Isla Mujeres, i sistemi di cenote scavati nel calcare dello Yucatán e i fondali bassi ricchi di erba marina che proteggono le giovani tartarughe marine. I siti di barriera si trovano in acque profonde da tre a otto metri, abbastanza bassi per il freediving ma abbastanza profondi da sostenere colonie di corallo a corna d'alce e corallo cervello centenarie. I percorsi dei cenote — in particolare quelli accessibili tramite il corridoio interno della Ruta de los Cenotes — scendono in doline d'acqua dolce dove le colonne di luce penetrano per 15 metri attraverso l'acqua tannica, illuminando foreste di stalagmiti sotto l'aloclino.
I tour in catamarano per Isla Mujeres uniscono lo snorkeling all'accesso al beach club, partendo dal porto turistico della zona alberghiera e attraversando la Bahía de Mujeres in 45 minuti. Imbarcazioni più piccole (panga) servono Puerto Morelos, dove la cresta della barriera corallina si trova a 500 metri dalla costa e le boe di ormeggio impediscono alle ancore di danneggiare le formazioni coralline. Gli operatori turistici che lavorano in questi siti impiegano guide bilingue certificate dalla Federazione Messicana delle Attività Subacquee, e i limiti di passeggeri per barca variano da otto a dodici, stabiliti dai regolamenti del parco per gestire la densità dei subacquei sulle formazioni fragili.
I mesi più calmi — da aprile a giugno, poi ottobre e novembre — offrono le condizioni più affidabili, sebbene le escursioni di snorkeling a Cancun operino tutto l'anno, eccetto durante le rare chiusure dovute a tempeste tropicali. La temperatura dell'acqua rimane costante tra i 26–29°C, eliminando la necessità di mute integrali. Molti operatori includono fotocamere subacquee nel pacchetto e la maggior parte delle gite rientra nel primo pomeriggio, lasciando la seconda metà della giornata libera per altre attività nella zona alberghiera.
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